Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms