Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms