Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms