Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms