Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms