Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASXL3Q9C0F0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASXL3Q9C0F0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms