Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms