Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms