Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms