Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPL3Q9BY60 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms