Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms