Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPOQ9BU64 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms