Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NICN1Q9BSH3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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