Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms