Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms