Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGIP1Q9BQI5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms