Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms