Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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