Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAMP1Q96JM3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms