Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAM5Q96HS1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAM5Q96HS1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms