Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGF29Q96ES7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms