Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFT1Q96AA3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms