Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms