Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KBTBD3Q8NAB2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KBTBD3Q8NAB2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms