Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT2Q8N9I0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms