Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMER3Q8N944 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms