Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms