Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms