Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms