Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC84Q86UT8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms