Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms