Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT9Q86SS6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT9Q86SS6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms