Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG9AQ7Z3C6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms