Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP43Q70EL4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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