Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf47Q6ZRZ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms