Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms