Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUSD1Q6UWL2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms