Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms