Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASC4Q6P4E1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms