Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDC4Q6P2E9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDC4Q6P2E9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms