Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms