Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOGA3Q5TF21 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms