Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms