Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC158Q5M9N0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms