Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFHC1Q5JVL4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms