Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms