Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms