Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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