Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms