Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDO1Q16878 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CDO1Q16878 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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